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化合物データ

Index Chemicus 索引を選択したとき、または Index ChemicusCurrent Chemical Reactions 索引の両方を選択したときに化合物データ検索を実行できます。所属機関が Index Chemicus 索引のみを購読している場合、システムは化合物レコードのみを返します。

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検索ロジックと規則

同じフィールドに複数の隣接する化学用語を入力するか、複数の検索フィールドに化学用語を入力して検索を開始した場合、暗黙的な AND 演算子が使用されます。次に例を示します。

  • Apoptosis AND Antineoplastic は、Apoptosis Antineoplastic と同じ数の化合物レコードと反応レコードを検索します。

正確な化学フレーズを検索するには、用語を引用符で囲みます。たとえば、enzyme activity は、フレーズ "enzyme inhibiting activity" または "enzyme activity" を含む化合物レコードを検索しますが、"enzyme activity" は、フレーズ "enzyme activity" を含む化合物レコードのみを検索します。

これらの規則は、以下の化学テキストフィールドに適用されます。

  • 化合物名
  • 化合物生物活性
  • 反応キーフレーズ
  • 反応コメント
  • その他

構造検索条件の括弧

検索条件で括弧を使用しないでください。たとえば、以下の検索条件で返される結果の数は Gly AND asp OR ser NOT val と同じです。

  • (Gly AND asp OR ser NOT val)
  • (Gly AND (asp OR ser) NOT val)
  • (Gly AND asp OR (ser NOT val))

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化合物データ検索

  1. [構造検索] ページの [詳細設定] セクションに移動して、検索するタイムスパンを選択します。

  2. 検索する化学索引(Index Chemicus および Current Chemical Reactions)を選択します。

  3. [化合物データ] セクションで、[化合物データ] 検索フィールド(複数可)に検索語を入力します。検索演算子でつなげて 11 個までの用語を入力できます。

  4. 反応に化合物のロールを指定するには、次のチェックボックスのいずれかをオンにします。

    ロール

    定義

    反応物

    反応過程で化学的に変化するもの。反応物は反応矢印の左側に表示されます。

    生成物

    反応により生成された化合物。生成物は反応矢印の右側に表示されます。

    触媒

    反応率に影響する化合物で、反応過程で化学的に変化しないもの。

    溶媒

    溶液の別の物質の溶解や分解に使用される液体。

    ノート: デフォルト設定ではすべてのチェックボックスがクリアされています。すべてのロールがクリアされている場合、各チェックボックスのオプションについて反応情報が自動的に検索されます。

    複数のロールを指定した場合、定義によって特定の反応情報を検索していることになります。これらのロールは Index Chemicus 索引には適用されません

  5. (オプション)[構造描画] セクション(上にスクロール)で化学構造クエリを作成します。

  6. (オプション)[反応データ] セクション(下にスクロール)で化学反応検索語を入力します。

  7. [検索] ボタンをクリックして、[反応検索結果] ページまたは [化合物検索結果] ページを表示します。

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検索を行うと、[反応検索結果] ページまたは [化合物検索結果] ページのいずれかが表示されます。次に例を示します。

  • Index Chemicus 索引のみを選択した場合、[化合物検索結果] ページが表示されます。

  • 両方の化学索引を選択して、化学クエリと一致する反応レコードが見つからなかった場合、[化合物検索結果] ページが表示されます。

  • 両方の化学索引を選択して、反応レコードと化合物レコードの両方が見つかった場合、[反応検索結果] ページが表示されます。

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[化合物データ] フィールド

化合物名

天然化合物の名前や化合物名を接頭辞を付けずに入力します。次に例を示します。

  • Mycotrien*
  • Carbacyclin((+/-)-Carbacyclin のような反応物および製品データを検索します)
  • C60 or C-60 OR fullerene* OR buckminster*

ノート: [化合物名] フィールドでは +/- のような文字を検索できません。

同じフィールドに 2 つ以上の隣接する化学用語を入力すると、暗黙的な AND 演算子が使用されることに注意してください。次に例を示します。

  • [化合物名] フィールドに Gly Asp Ser と入力するのは、Gly AND Asp AND Ser と入力するのと同じです。

ハイフン付きの用語は、ハイフンありとなしで入力できます。どちらの場合も、同じ数の結果が返されます。次に例を示します。

  • 検索エンジンによって暗黙的な AND 演算子が使用されるため、[化合物名] フィールドに Gly-Asp-Ser と入力するのは、Gly Asp Ser と入力するのと同じです。

正確な化学フレーズを検索するには、用語を引用符( " " )で囲みます。

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化合物生物活性

[生物活性リスト] リンクをクリックして検索支援機能に移動し、検索に追加する生物活性を指定します。検索支援機能では、検索条件に追加する 1 つ以上の検索語を選択できます。

たとえば、[生物活性リスト] 検索支援では、以下のような検索語を選択できます。

  • Acetylcholine Atagonistic Activity
  • Calcitonin Gene-Related Peptide Antagonistic Activity 
  • Deixyhypusine Synthase Inhibiting Activity

同じフィールドに 2 つ以上の隣接する化学用語を入力すると、暗黙的な AND 演算子が使用されることに注意してください。次に例を示します。

  • [化合物生物活性] フィールドに Acetylcholine Atagonistic Activity と入力するのは、Acetylcholine AND Atagonistic AND Activity と入力するのと同じです。

ハイフン付きの用語は、ハイフンありとなしで入力できます。どちらの場合も、同じ数の結果が返されます。次に例を示します。

  • [化合物生物活性] フィールドに 11-Beta-Hydroxysteroid Dehydrogenase* と入力するのは、11 Beta Hydroxysteroid Dehydrogenase* と入力するのと同じです。

重要なノート: 検索支援で選択した用語を使用したフィールドの検索方法については、「生物活性リストの複数の用語の選択」を参照してください。

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分子量

大なり記号 (>) や小なり記号 (<) を前に付けて単一値を入力します。≥ および ≤ 関係演算子も使用できます。次に例を示します。

  • >500
  • <1000
  • Between 50 AND 75

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化合物データ検索について

所属機関が Index ChemicusCurrent Chemical Reactions を購読している場合、化合物データ検索を実行すると、化合物レコードと部分反応レコードの 2 セットの検索結果が生成されます。このため、化合物データ検索条件が検索履歴テーブルに 2 回リストされます。化合物の検索では、25 の化合物レコードと 10 の部分反応レコードが検索されます。25 の化合物は、1 つのセットに属し、10 の反応は別のセットに属します。

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短縮

すべてのテキストフィールドで前方一致を使用できます。

以下のワイルドカードの前に少なくとも 1 つの文字を入力してください。

  • アスタリスク(*)
  • 疑問符(?)

詳細は、「ワイルドカード」を参照してください。

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Boolean 演算子

すべてのテキストフィールドで以下の Boolean 演算子を使用できます。

  • AND
  • OR
  • NOT

ノート: 構造検索では SAME および NEAR Boolean 演算子はサポートしていません。

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関係演算子

すべての数値フィールドで以下の数値演算子を使用できます。

  • <(より小さい)
  • >(より大きい)
  • ≤(以下)
  • ≥(以上)
  • =(等しい)
  • Between

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Between 演算子

数値フィールドで Between オプションを選択すると、値を指定する新しいフィールドが表示されます。値が [Between] フィールドに入力した値と [And] フィールドに入力した値の間にある結果が返されます。

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